মামলার এজাহার সূত্রে জানা যায়, বোরহান উদ্দিন তার নিজ ও স্ত্রী সুস্মিতা উদ্দীনের নামে শাহজালাল ইসলামী ব্যাংক লিমিটেড ও ইসলামী ব্যাংক লিমিটেড পরিচালিত ৫টি ব্যাংক হিসাবে বিভিন্ন সময়ে মোট ১৪ কোটি ১৯ লাখ ৯৭ হাজার ২২৮ টাকা নগদে, চেকে ও ট্রান্সফারের মাধ্যমে জমা ও লেনদেন করেছেন। যার কোনো বৈধ ওয়ারিশ না পাওয়ায় দুদকের অনুসন্ধানে তা অবৈধ লেনদেন এবং অবৈধভাবে অর্জিত আয় হিসেবে প্রমাণিত হয়েছে। এ ঘটনায় তাকে আসামি করে একটি মামলা দায়ের করেছে দুদক।
দুদক সূত্র জানায়, ইসলামী ব্যাংকের পরিচালক এনআরএম বোরহান উদ্দিন ক্ষমতার অপব্যবহার করে তথ্য গোপন করে ডিএমডি নিয়োগে সহায়তা করেছেন বলে অভিযোগ আছে। এছাড়া তিনি ব্যাংকের বিভিন্ন অডিট আপত্তি নিষ্পত্তিতে পক্ষপাতিত্ব ও প্রভাব খাটিয়ে অসৎ উদ্দেশ্য হাসিল করেছেন। দুদকে আসা এরকম ৭৩ পাতার অভিযোগ যাচাই-বাছাই শেষে চলতি মাসে অনুসন্ধানের সিদ্ধান্ত নেয় কমিশন। এজন্য দুদকের উপ-পরিচালক মো. সামছুল আলম অনুসন্ধান কর্মকর্তা এবং বিষয়টি তদারকি করার জন্য পরিচালক সৈয়দ ইকবাল হোসেনকে দায়িত্ব দেয়া হয়। অনুসন্ধানে তার বিরুদ্ধে বিপুল পরিমাণ অর্থ লেনদেনের প্রমাণ পাওয়া যায়। বাকি অনুসন্ধান কাজ এখনো চলমান রয়েছে।
এর আগে গত ১৭ ফেব্রুয়ারি এসব অভিযোগ অনু্সন্ধানে ইসলামী ব্যাংকের এই পরিচালককে জিজ্ঞাসাবাদ করে অনুসন্ধান কর্মকর্তা। জিজ্ঞাসাবাদ শেষে সাংবাদিকদের অনেক প্রশ্নেরই উত্তর না দিয়ে অনেকটা উল্টো অভিযোগ করে এনআরএম বোরহান উদ্দিন বলেছিলেন, ‘দুদক আমাকে হয়রানি করছে। অনুসন্ধানের এ পর্যায়ে এর বেশি কিছু বলা যাবে না।’